データクリーンルームは機密性の高いデータを扱うため、データのプライバシー保護とセキュリティ対策が最優先事項となります。適切なアクセス制御、データの匿名化、暗号化技術の使用、厳格な認証手続きなどが必要です。

異なるソースから集めたデータを統合する際、データの整合性を維持することが重要です。不整合なデータは分析結果に悪影響を及ぼす可能性があり、データクリーンルームでは高品質なデータが求められます。データの欠損や誤りを防ぐためのデータクリーニングが不可欠です。

データクリーンルームの構築と運用は技術的に複雑であり、専門的な知識とスキルが必要です。システムの設計、データパイプラインの構築、セキュリティ対策などの技術的な課題を解決する必要があります。

ハードウェア、ソフトウェア、セキュリティ対策など、多岐にわたるコストが発生するため、導入コストや維持・運用にかかる継続的なコストも考慮しなければなりません。